Η Ελληνική Καρδιολογική Εταιρεία οργανώνει το τελευταίο Σαββατοκύριακο του Οκτωβρίου το Ετήσιο Πανελλήνιο Καρδιολογικό Συνέδριο. Σκοπός των Πανελληνίων Συνεδρίων είναι η ανάπτυξη της επιστημονικής γνώσης και η εξοικείωση των Νέων Καρδιολόγων με τις νέες τεχνικές και εξελίξεις της Καρδιολογίας. Στο ΠΚΣ καλούνται να συμμετάσχουν Επιστήμονες αναγνωρισμένης επιστημονικής αξίας από το εξωτερικό. Οι Έλληνες Καρδιολόγοι συμμετέχουν με ομιλίες, ελεύθερες και αναρτημένες ανακοινώσεις.  Κατά τη διάρκεια του ΠΚΣ ανακοινώνονται οι βραβεύσεις των νέων ερευνητικών πρωτοκόλλων, των Καλύτερων Εργασιών Νέων Καρδιολόγων και η χρηματοδότηση νέων υποτρόφων.